Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou4f1P17208 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms