Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm45217-201ENSMUST00000206576 1026 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm8261-201ENSMUST00000119275 1208 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms