Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UbbP0CG49 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UbbP0CG49 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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