Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cfdp1O88271 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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