Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Lnx1O70263 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms