Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TsksO54887 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TsksO54887 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TsksO54887 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TsksO54887 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TsksO54887 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TsksO54887 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TsksO54887 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms