Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms