Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Opn1mwO35599 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Opn1mwO35599 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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