Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Kcns1O35173 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Kcns1O35173 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Kcns1O35173 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Kcns1O35173 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Kcns1O35173 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Kcns1O35173 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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