Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms