Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp35M0QWN7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Usp35M0QWN7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp35M0QWN7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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