Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm2056J3QQ02 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms