Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm8888J3QPX5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm8888J3QPX5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8888J3QPX5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms