Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5849J3QPE5 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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