Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm21976J3QNN2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm21976J3QNN2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm21976J3QNN2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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