Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms