Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp9yF8VPU6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp9yF8VPU6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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