Protein–RNA interactions for Protein: F6ZED4

Gm9970, Predicted gene 9970, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9970F6ZED4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9970F6ZED4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms