Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm8247F6VRJ8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms