Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms