Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Myo5cE9Q1F5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms