Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ddx60E9PZQ1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ddx60E9PZQ1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ddx60E9PZQ1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ddx60E9PZQ1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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