Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ttc17E9PVB5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc17E9PVB5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms