Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Gcn1E9PVA8 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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