Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syde2E9PUP1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syde2E9PUP1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms