Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm3543D3Z235 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms