Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprbB2RU80 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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PtprbB2RU80 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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PtprbB2RU80 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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