Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rrn3B2RS91 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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