Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms