Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nfx1B1AY10 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms