Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Rcan2-201ENSMUST00000044792 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Tmem238A9JSM3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms