Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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