Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Odf2A3KGV1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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