Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Gm6880A3KG45 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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