Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms