Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms