Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3550W4VSN7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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