Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Krt27Q9Z320 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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