Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn8Q9Z260 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn8Q9Z260 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn8Q9Z260 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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