Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ilf3Q9Z1X4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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