Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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