Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Col4a4Q9QZR9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms