Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ercc4Q9QZD4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Ercc4Q9QZD4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Ercc4Q9QZD4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ercc4Q9QZD4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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