Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Kcnip3Q9QXT8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms