Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Dclk1Q9JLM8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Dclk1Q9JLM8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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