Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TefQ9JLC6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TefQ9JLC6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms