Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ldb3Q9JKS4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms