Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nectin1Q9JKF6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms