Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms