Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clstn2Q9ER65 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms